1938年4月，国民**撤退武汉，邓葆光遇到了久违的老师董必武。董必武说：“你留学日本，学成回国，进入‘军统’，我都知晓。只要你专心研究日本，专心抗日，不做坏事，人民终会理解你的。”

邓葆光保证：“谨记，老师请看学生的行动，绝不辜负老师厚望。”

武汉即将沦陷时，邓葆光接受戴笠指示:“潜伏武汉，担任军统站经济组组长。”搜集日军经济情报。完成任务回到重庆后，着手总结武汉沦陷区的工作经验，对比研究大后方的经济状况。当时大后方并不是享乐之地，物资实在匮乏。重庆**提倡爱国，抵制日货，甚至还要抵制来自沦陷区的“汉奸货物”。

此种政策岂止是自我封闭，而恰恰有利于日方，使中国大后方军民日需更加拮据困顿。军统的日常开支经费都捉襟见肘。邓葆光给戴笠打了一份报告：“强调：为彻底打败日本侵略者，不只在两军对垒的战场，更要有经济政策上的灵活，即鼓励商人把生意做到敌占区去，一方面严厉禁止后方的粮棉进入沦陷区，一方面还得去沦陷区抢购日用物资。建议：立即设立缉私处（防止棉粮外流）、货运局（抢购沦陷区物资）；在总动员会议机关设经济检查机构，统一规划、管理、监督战时物资调配和流动，控制后方物价。”

戴笠审阅了邓葆光的“报告”，非常重视，立即将报告急转蒋介石，蒋先生阅后转行政院，要求全面实施。邓葆光因此受到重用，不久，被提升为经济科军简三阶（文职同上校）科长、经济研究室主任、行政院国家总动员会对日经济作战委员会常务委员等职。

负责指挥抢夺沦陷区物资，掌管缉私、战时物流货运工作，管理战时物价和打击投机倒把等事务。1941年秋，邓葆光看到的一则“日本将以橡胶换取苏联的木材”报道，邓葆光自我提问:“日本既不生产橡胶，何以橡胶易木材?”看来，日本不会空穴来风，必有可图之机，才敢于没有橡胶换东西。

那么，橡胶产于南方，只有南洋群岛的橡胶距日本最近!邓葆光由此而研究日本掠夺中国所采取的军事步骤。邓葆光突然醒悟:美国驻守南太平洋的军队，重力放在珍珠岛!这儿是美国最大的空军基地，东距火奴鲁鲁9.6公里，水深15-18米，因湾内盛产珍珠而得名;1911年美在此又建成海军基地。日本只有突击南太平洋的军队，方可取得南洋橡胶。

作为世界上第一个预测到日本将发动太平洋战争偷袭英美军事基地的人，葆光立即上报戴笠，以绝密电报郑重告知英、美：“日军极可能不宣而战，进犯南太平洋，袭击英、美海军基地！”，但是却没有引起英、美的重视，直到后来偷袭珍珠港事件发生后，太平洋战争爆发，英、美才重视与军统的合作。此外，邓葆光还专门负责收集编写全国经济物价动态，供当局最高领导层参考。